При чем тут протокол Овен ? я про работу Com порта. Mono это среда разработки .NET приложений, и приложения, написанные на C# в Windows работают под Linux. dll, работающая с портом не требует изменения кода.
Вот и посмотреть как происходит работа с портом непосредственно на Linux.

Ну или вообще попробуйте на Linux в Mono в среде разработки свои исходники загрузить, наверняка что-то выясните...