Если оно уходит в контроллер, то перезагрузка панели никак не должна на него влиять.
Вы не могли бы выложить проекты для панели и ПЛК? Все лишнее можно вырезать, достаточно оставить обмен одним регистром, который не сохраняется после перезагрузки.