Если значения не обновлялись, то, скорее всего, проблема заключалась в параметре Всегда обновлять переменные во вкладке Соотнесение входов/выходов, необходимо выставить Включено 2 (Всегда в задаче цикла шины).
По поводу невменяемых значений - не пробовали менять местами старшее и младшее слово/байт?