Добрый день. Разницы особой нет. Просто транзисторы обычно используют там где нужна большая частота переключений. Считаются более долговечными, так как нет механического износа как у реле и нет пригара и залипания контактов. Используются в основном для управления ТТР.
В Вашем случае частота выходов всё равно ограничена промежуточными реле, так что смело ставьте. У нас работают годами без проблем.
С уважением.