Здравствуйте.

Поздравляем всех с наступившими праздниками, Новым годом и Рождеством!

Относительно вопроса.
Что Вы подразумеваете под словом "тарировка"? Юстировка или просто установка кода типа датчика? Юстировать прибор имеет смысл в самую последгнюю очередь.

Термопары действительно могуть влиять друг на друга, если они не изолированны и все подключаются к электропроводящей поверхности. Собственно, что и происходит в Вашем случае. Поэтому, в первую очередь рекомендую Вам попытаться изолировать термопары от радиатора (через слюду или через любой другой диэлектрик)...
Что касается термосопротивления, то оно действительно более точно измеряет и у него нет погрешности вносимой холодным спаем.
Но здесь возникает вопрос температур и компактности.