Rtrig поставьте перед счетчиком.

опрос входов, есть 1 или нет ? Например НЕТ, цикл программы - не сработает Rtrig, запись выходов
опрос входов 0 или 1 ? есть 1, цикл программы - сработает Rtrig, запись выходов
опрос входов 0 или 1 ? есть 1, цикл программы - не сработает Rtrig так как уже 1 была, запись выходов.

А Rtrig собственно есть в счетчике, и по идее его ставить не надо.
при длине импульса 50 мс и цикле программы 10 мс вход будет 5 раз опрошен.