Что Вы понимаете под управлением входами ПЛК? К ним физически что-то подключено. Оно ими и управляет. Если Вы хотите из визуализации изменить значение, полученное с физического входа ПЛК, то в программе сделайте проверку, например если пришел сигнал из визуализации, то игнорировать физический вход ПЛК. Тогда и получится приоритет у визуализации.