Может имела место быть помеха по питанию, в результате чего возник сбой прошивки Pic'a.
В любом случае, даже если входы не сгорели, а просто слетела калибровка, то необходимо отправить контроллер в сервисный центр для калибровки, заодно и Pic перепрошьют. Только желательно приложить к контроллеру описание проблемы с аналоговыми входами, и про выходы написать.