Протокол я так понимаю ОВЕН.
Вы считываете параметр r.Cou - это и есть значение счетчика.
А нужно считывать параметр r.Cn - это битовая маска входов. (страница 26-27 документации на МДВВ). Она находится в Input (без номера) и одна на все входы.
Полученную маску нужно будет разложить, чтобы получить состояние каждого входа по отдельности. Для этого используется функциональный блок "Распаковка аналогово 32 битного значения"
