В принципе логика верна, однако:
вы забываете, что 50000 перезаписей - это стандарт для любой флэш памяти, даже той, которую Вы имеете для переноса информации.
В ПЛК организована файловая система, которая позволяет распределять запись файлов по всей памяти flash - а это порядка 3Мб. А при условии, что перезапись происходит по всей памяти равномерно ресурс сильно увеличивается.