у вас для вашей программы ПЛК должна быть карта регистров, начиная с 0 и учитывающая выравнивание (смотрите документацию). Согласно этому настраиваете опрос переменных, возможную перестановку байт или регистров, специфичную для ПЛК например для переменных float (real).
ну и собственно попутный вопрос, а так ли вам нужна MasterScada? просто потому, что на слуху или это требование заказчика?, если первое, держитесь от нее подальше
есть масса других и более быстрых и более простых для понимания Scada систем