Если будете так менять целевую платформу, потом проблем не оберётесь. Галки трогать не надо.
Для правильной смены, после замены типа ПЛК, надо нажать Дополнения/ Стандартная конфигурация, тогда у вас действительно изменится целевая платформа, но вы получите её новую и пустую.
Всё что было в конфигурации надо набить снова или перенести с помощью программы. Обязательно сделайте дубликат проекта.
И лучше для начала потренироваться в переносе конфигурации ненужного простенького проекта.
Так же есть проблемы при переносе конфигурации из старых на новые ПЛК [M02] V.2, читайте по ссылке.
Здесь программа https://owen.ru/forum/showthread.php?t=18269