Под невалидными связями я понимаю те, которые могли быть изменены (чаще удалены) при редактировании переменных/ФБ. Например, в списке входов мнемосхемы все когда-либо указанные входы остаются вне зависимости от того, удалена соответствующая связь или нет. Если приходится устанавливать связь с другой переменной, но функция её такая же, как и у прежней, то выдаётся ошибка, что вход с таким названием уже существует. Приходится сначала его удалить, а затем назвать новый вход так же. Нужно помнить, какие входы были изменены и т. д.
Неопределённое состояние визуального ФБ показывается как светло-серое?