FB используют общую память, насколько помню всегда и везде, не только в Овен ПЛК.
А вот изолированы как раз FUNC (Функции)...

Возможно когда вы включаете свет на Кухне и тут же в Кабинете, FB не понимает, что от него хотят, ну или где-то происходит сбой из-за этого.
Думаю вся проблема в FB и как ее вызывают, но тут только отладкой.

Точнее когда FB объявляется несколько раз, то под каждый используется свой блок памяти, возможно в конкретном FB есть использование каких-то переменных, что при вызове нескольких FB дает пересечение памяти.