Если есть непреодолимое желание мерить температуру холодных концов в месте соединения термопары с компенсационными проводами, то и напряжение надо мерить там же (геморроя будет много, но результат при вычислении температуры спая будет такой же как и при измерении температуры холодных концов и напряжения на зажимах прибора). Только непонятно зачем тогда подключали компенсационные провода.
Надеюсь ты понял всю бредовость своей навязчивой идеи.