Чтобы понять это - стоит почитать любую подробную статью про выравнивание данных.
Начать можно с википедии:
https://en.wikipedia.org/wiki/Data_structure_alignment
По практической составляющей вопроса - в CODESYS V3 можно управлять выравниванием с помощью атрибута, указываемого при создании структуры:
https://help.codesys.com/webapp/_cds...rsion=3.5.16.0