1) Макросы
Создал макрос с двумя булевскими выходами
поместил его во внутрь другого макроса с одним булевскив выходом (1й выход вложеноого соединен с 1м выходом родительского)
на схему пометил оба макроса соединил сразу с выходами прибора.
при удалении во вложенном макросе первого выхода на схеме появляется сообщение, что макрос был изменен и его необходимо заменить из библиотеки компонентов.
т.е. краха не наблюдается.

2) Нет ошибки при вызове меню "Настройка прибора"

3) Ошибка при удалении третьей строки подтвердилась будем править.

4) Январские приборы не будут корректно работать с новым лоджиком.

5) Проблем с эмуляцией так же не наблюдаю.

возможно эти ошибки связаны (2,3 и 4). Можете сохранить проект и выложить его?
Проект с макросом и указанием какой выход удалить тоже выложите пожалуйста.