Я использую 2010. Проблема заключается в том что файл проекта немного отличается у версий 2005 и 2010. Но студия при первом запуске предлагает сконвертировать проект. Это занимает несколько секунд.

Восклицательные знаки, скорее всего, означают что студия не знает где искать эти библиотеки. Нужно ей показать. Они лежат в корневом каталоге MasterSCADA.