Ну библиотеки можно по новой подключить в ПЛК конфигураторе в соответствующем разделе. Старые удалите.
Я делаю так 1добавил-старую удалил, затем следующую.
ПЛК перешейте на последнюю оф. версию и заново загрузите соответствующий таргет.
Что-то у вас по версиям не срастается.