Что то непонятное.
Зачем ждать несколько часов чтобы он начал нормально работать?
При включенном питании контроллеру ведь всё равно как у него заряжена батарея, неужели уровень заряда батареи контроллера напрямую зависит от качества его работы при включенном питании?