1.Панель включается быстрее ПЛК.
2. ПЛК загружается сам, начинается сетевой обмен (работа с областью входов\выходов), и уже после этого выполняется программа, которая и запишет значение переменных из Retain или из области памяти входов.

Вот в момент, пока ПЛК не начал выполнять программу - панель увидела нули, и записала нули в область входов. Она ведь не только записывает по Ent но и постоянно опрашивает указанные регистры.