Да, создание ФБ, ВФБ и ActiveX элементов в MasterSCADA возможно, и не является сложной задачей.
К MasterSCADA прилагается соответствующая документация, она находится в MasterSCADA - Руководство по разработке ФБ и драйверов.
Для решения нестандартных задач, вы также можете использовать модуль "Скрипт".