По поводу внесения фатальных изменений.
Экспортировал в DBF файл, перезагрузил конфигуратор, и тут-же DBF импортировал (т.е. не редактировал редакторами DBF), значения поля "Атрибут редактирования" везде слетают на "редактируемый".

Если будет встроенная функция клонирования программ - тогда всегда этому рад. Но нужно и клонирование уставок программ. Желательно уметь клонировать шаги программы по отдельности.