Можно.
Удалите новый Target, поставьте старый.
Откройте проект. Перейдите в Target Settings и заново выберете Ваш тип контроллера.
После этого перейдите в Конфигурацию ПЛК и из меню дополнительно выполните команду - стандартная конфигурация.
ВАЖНО: при этом все настройки конфигурации ПЛК сбросятся... так что заводите резервный проект.
На работу SFC смена прошивки или Target влиять не должна - внимательно смотрите программу, может переменные объявили несколько раз, может быть еще что то...