Для того, чтобы в ПЛК оказался файл проекта, а именно проект который Вы делаете в CoDeSys - *.pro необходимо настроить CoDeSys - а именно поставить галочку - записывать исходный проект.
Тогда сам файл проекта пишется на Flash контроллера, и Вы его оттуда можете взять.
Если так не сделать - никакие другие возможности получить программу не существуют...

А лучше просто храните проекты.

З.Ы.: С ПЛК63 эта функция не работает -у него Flash памяти нет.