Что можно сказать.
1. Джамперы мастер-слейв - это резисторы подтяжки. На режим работы модуля в ПР никак не влияют. Можете забыть про них.
2. По поводу монтажа. Интересно, реле и иные выводные детали ставит робот или монтажник? И паяет их волна или монтажник?
3. По поводу ПО. То, что нужен один архив - это однозначно. Список требований - однозначно. Про то, что сейчас все будут опираться на .net, c runtime и т.п. - это увы необходимость. Сложные программы, забудьте про чистый win api. Но и МС не будет поддерживать устаревшие ОС по многим, особенно финансовым причинам. Поэтому - переходить на новые ОС придется, к сожалению.