Можете прикрепить проект конфигуратора? Возможно какая то уникальная комбинация настроек приводит к такому поведению.... у меня на 1.1.2 пока не проявляется (хотя проявлялось на 1.1)
К сожалению проект не сохранился, перепрошил ещё раз и проблема вроде как не повторялась, единственное смутило, что после перепрошивки через embSoft конфигурация сохранилась, так и должно быть?