Переменные:
Вход - физический быстрый вход ПЛК
Циклы - счетчик циклов таймера.
Импульсы - счетчик зафиксированных импульсов.
Выход - посчитанное количество импульсов. (глобальная)

Программа для таймера:

Циклы:=Циклы+1;
Если передний фронт Вход то
Импульсы:=Импульсы+1;
конец_если;

Если Циклы=50000 то
Циклы:=0;
Выход:=Импульсы;
конец_если;
------
В результате в глобальной переменной Выход получаем количество импульсов за 50000 циклов таймера.
Дальнейшая математика выполняется в теле основной программы ПЛК.