Для того чтобы иметь возможность выгрузить проект из контроллера,
необходимо на этапе загрузки проекта в контроллер произвести Загрузку исходного кода
(Онлайн --> Загрузка исходного кода).
В случае если исходный код был загружен в контроллер,
можно выгрузить его в Codesys с помощью одноименной команды из меню Файл --> Выгрузка исходного кода.

Если загрузка исходного кода на этапе загрузки проекта не была произведена,
то в случае выгрузки проекта Codesys выдаст ошибку.