Вы имеете ввиду: возможно ли выполнять вычисление управляющего воздействия для двух исполнительных механизмов по ПИД закону в Codesys? Теоретически ничего не мешает, но возможно в реальных контроллерах может не хватить аппаратных ресурсов по вычислению. Сколько ФБ ПИД регуляторов можно запустить в каждом ПЛК, чтобы не было "лагов" это вопрос уже немного другой.