Решил вопрос аппаратно, поставил 1 cекундный таймер TON на бит управления тревогой, теперь он на импульсы длительностью менее 1с - не реагирует. А то, что сигнал аварии сработает с секундной задержкой, меня вполне устраивает. Теперь, когда снимаю питание с панели и контроллера и вновь подаю, окно тревоги не выскакивает.