А как ведут себя термопары при изменениях температуры после этих 80 минут ? Как вы их калибруете, если неизвестен их материал и тип спая?
После 80 минут показания стабильны. Похоже, что на их показания влияет прогрев модулей ввода, но там ведь встроено средство компенсации температуры холодного спая. Калибровкой наверное есть смысл занятся после устранения описанного в посте явления.