Термопара вырабатывает ЭДС, пропорциональную разности температур горячего и холодного спаев. Если вы утверждаете, что температура в точках замера не изменяется, следовательно, не работает компенсация температуры концов, и по мере прогрева модулей вы видите изменение показаний. Термопары хороши для измерения высоких температур, сотни градусов, когда температура холодного спая влияет слабо. Измерять комнатную температуру термопарой - плохая идея.
