Пропуски будут в зависимости от скорости вращения энкодера. У меня в одном проекте реализована функция детектирования нуля энкодеоа. Но:
1. Энкодер 360имп\об вращается со скоростью не более 20 об\мин.
2. Я не применял FastEncoder, а реализовал энкодер программно в прерывании по таймеру 20мкс. (ПЛК110-60 старой модели)
3. Детектирование нуля условное Т. е. IF Энкодер =>0 OR Энкодер <=2 THEN Действие.