конфигурационная переменная

Кто может пояснить, почему в ПЛК63 если переменная оперативная, то читается по Modbus, если конфигурационная, то нет (читается всегда ноль)?

потому что читается её значение по умолчанию, т.е её уставка, к-я у вас, вероятно, стоит=0.
конфигурационные переменные тем и отличаются от оперативных, что не меняют своего значения просто путем копирования в них.