Так то в самой КДС в опциях есть что то про кодировку, поумолчанию вроде одна из латиниц,а не cp1251 или юникод, может достаточно её "по дергать"
Всё получилось после очередного ковыряния реестра и перезагрузки. Ура. Всем спасибо!
У меня такая же проблема, подскажите, что в реестре поправить?
В Codesys. "Опции" -> "Редактор" -> "Шрифт" -> "Анимация" -> выбрать "Кириллица". До этого проводил манипуляции с реестром - не помогло, после этого исправил шрифт, все отлично.
Возможно реестр трогать и не обязательно.